中研院也建議農委會要加強休耕活化，設立農科院。農委會主委陳保基表示，農委會今年已啟動「做一休一」（耕作一期休耕一期）活化休耕地政策，可望活化四點五萬公頃農地，藉此提高我國糧食自給率達百分之卅五，至少創造十萬個工作機會，產值估計達八十八億元。
陳保基表示，活化休耕地政策一直是他上任一年多來，最重要的改革重點；他指出，中研院列出的問題，農委會早就想到，也要把政府每年花一百億元補助休耕，改拿來獎勵生產；舉例來說，台灣茶具外銷潛力，活化休耕地計畫日前也將把茶葉納入「地方特產」，要讓原本種茶的桃竹苗、南投等休耕地，不種水稻改種茶葉，收益比休耕、種稻還好。
